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净信样品前处理仪器:让致病微生物无所遁形

发布时间:2020/12/16 点击量:

  不久前,“中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识” 在《中华传染病杂志》发布,这是全球首篇针对所有感染性疾病的宏基因组学临床应用专家共识。二代测序病原检测技术越来越普及,宏基因组测序(mNGS)描述了样本中存在的所有DNA或RNA信息,此技术能够分析整个微生物组以及患者样本中的人类宿主基因组或转录组,避免用药失误,把握最佳治疗时间,做到精准医疗。

  

  对于不明原因的疾病,及早的进行感染病原微生物高通量的检测,是一种行之有效的办法,为医生早期诊断提供机会,为患者赢得治疗的时间,又可以节省不必要的费用。2014年新英格兰医学杂志报道过一个通过宏基因组辅助检测治愈了一位原因不明、反复发热、具有癫痫及脑积水症状的14岁男孩的案例,这是历史上首个宏基因组临床应用成功的案例。文章报道这个常规治疗及病原筛查都没有确诊原因,随后对脑脊液样本mNGS筛查,结合生物信息学分析结果发现一种可疑的致病菌 leptospira infection,随后针对性地使用万古霉素和头孢吡肟治疗后出院。该团队确认这是一种尚未报道过的病原微生物。由此,临床宏基因组正式应用于微生物诊断拉开了帷幕。

  病原微生物

  那么,什么是病原微生物?病原微生物是指可以侵犯人体,引起感染甚至传染病的微生物,或称病原体。病原体中,以细菌和病毒的危害性最大。病原微生物指朊毒体、寄生虫(原虫、蠕虫、医学昆虫)、真菌、细菌、螺旋体、支原体、立克次体、衣原体、病毒。病原微生物已成为全球关注的焦点。据WHO统计,在中国,感染性疾病占所有疾病的50%以上。面对重症感染患者,能否快速确认感染病原体,成为后续对症治疗的关键。

  医学检验中采集病原微生物用于mNGS的样本样本类型主要有静脉血、脑脊液、肺泡灌洗液、痰液、胸水和腹水、咽部分泌物、局灶穿刺物、组织等多种类型。mNGS的检测流程可以大致分为5个步骤:核酸提取、文库构建、上机测序、生信分析与报告解读。对病原微生物进行测序前处理过程中关键的一步就是核酸提取,因为病原微生物核酸提取效果的好坏,会直接影响到后续测序的成败。

  病原微生物提取流程

  然而上核酸提取仪之前,都需要进行样品的前处理。前处理设备的好坏直接影响着后序检测数据的精确度、灵敏度,规范的操作也是其中重要的条件;另外,检测的样品如果被外部所污染,也可能会影响检测的结果。上海净信在前处理这块专注了十几年,研磨仪系列产品上市十几年以来,经得住客户和市场的验证,在业内具有良好的口碑。在医学检验应用这块也广被客户认可。

  净信样品研磨仪能将任何来源(包括土壤、植物和动物的组织/器官、细菌、酵母、真菌、孢子、古生物标本等)的原始DNA、RNA和蛋白质进行提取和纯化。 只要将样品和研磨球放入研磨仪内(配置研磨罐或离心管/适配器),在高频摆动作用下,研磨球在研磨仪内来回高速撞击及摩擦,在非常短的时间内便可完成样品的研磨、粉碎、混合及细胞破壁。

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